Ο Christian Louboutin γεννήθηκε στις 7 Ιανουαρίου του 1963 στο 12ο διαμέρισμα του Παρισιού.
Το μόνο αγόρι ανάμεσα σε τρεις αδελφές. Ηταν ο γιος της Irene, μιας νοικοκυράς και του Roger, ένας κατασκευαστής ραφιών και γραφείων. Τον απέβαλαν από το σχολείο του, 3 φορές. Στα 12 αποφάσισε να σταματήσει την εκπαίδευση εγκαταλείποντας ταυτόχρονα και το σπίτι του. Πήγε να ζήσει σε ένα φιλικό σπίτι με τις ευχές της μητέρας του.
Στην οικογένειά του ήταν ο μόνος με σκούρο δέρμα, οπότε έστησε μια ιστορία γύρω από τον εαυτό του ότι είναι υιοθετημένος και οι πραγματικοί του γονείς είναι από την Αίγυπτο. Μια αδερφή του ωστόσο θα ανακάλυπτε λίγο αργότερα ότι ο βιολογικός του πατέρας ήταν πράγματι Αιγύπτιος, και ο ίδιος γεννήθηκε μετά από μια παράνομη σχέση της μητέρας του με τον άνδρα από το Κάιρο.
Από τα παιδικά του χρόνια του άρεσε να σχεδιάζει παπούτσια. Αυτός ήταν και ο λόγος που δεν ήθελε να συνεχίσει να πηγαίνει στο σχολείο.